Program Studi Magister Pendidikan Biologi menghasilkan lulusan yang memiliki kemampuan lanjutan dalam bidang pendidikan biologi dan penelitian ilmiah. Lulusan diharapkan dapat mengembangkan kurikulum, metodologi, dan strategi pembelajaran yang lebih efektif untuk meningkatkan kualitas pendidikan biologi di berbagai jenjang. Selain itu, mereka juga dilatih untuk melakukan penelitian yang dapat berkontribusi pada perkembangan ilmu pendidikan biologi dan pemecahan masalah pendidikan di masyarakat.

Lulusan Program Studi Magister Pendidikan Biologi juga mampu berperan sebagai pemimpin atau pengelola pendidikan di lembaga pendidikan atau institusi terkait, serta dapat berkolaborasi dalam proyek-proyek penelitian dan pengembangan di bidang pendidikan dan biologi.